Создана компьютерная модель вируса гриппа А

Англия

• Жизнь

Исследователи из Оксфордского университета построили первую компьютерную модель внешней оболочки вируса гриппа (influenza A). При помощи этой конструкции ученые смогут узнать как вирусам удается выживать в неблагоприятной среде, к примеру, в условиях пресноводных водоемов,что можно будет использовать для борьбы с вирусными инфекциями.

В математическом моделировании использовался метод крупнозернистого молекулярного динамичного моделирования ( coarse grained molekular dinamics simulation), который позволяет изучать поведение оболочки вируса при разных температурных фонах и разном составе мембран клеток, атакуемых вирусом. Моделирование начинается с момента, когда оболочка вируса является шаром диаметром 73 нанометра из свободно упакованных липидов. Затем этот шар сокращается до 59 нанометров, что происходит за 300 наносекунд. Такой процесс позволяет обнажить вирусные белковые шипы, рецепторы и аттракторы, спрятанные в оболочке вируса и используемые для проникновения сквозь клеточную мембрану.

Пока в модели используется только один экземпляр вируса, находящийся в капле воды. Предполагается введение в эту среду виртуальных растворов лекарственных препаратов, как поясняет сотрудник Оксфордского университета Тайлер Редди (Tyler Reddy).

Учеными установлена интересная особенность шипов вируса - они не переплетаются и не объединяются с другими аттракторами и рецепторами. Этот момент является ключевым для увеличения силы взаимодействия между вирусом и клеткой- хозяином. Ранние исследования показали, что новые устойчивые штаммы вирусов гриппа могут возникать в пресноводных водоемах, где их переносчиками являются водоплавающие птицы. В водную среду попадают с отходами слабые концентрации противовирусных препаратов, из- за воздействия которых на исходные штаммы и возникают новые мутации, устойчивые к этим препаратам. Математическое компьютерное моделирование позволяет понять динамику процесса образования новых видов гриппа и вести активный поиск принципиально иных средств и методов борьбы с ними.

Вера Максимова, 25.02.2015 10:42