Версия 1

Основой фамилии Екенин послужило имя Екеня. Фамилия Екенин образована от имени Екеня, которое является уменьшительной формой крестильных имен Евстигний, Викентий, Иннокентий.

Имя Евстигний в переводе с греческого означает «благой родственник», по другой версии, оно переводится как «хороший знак». Имя Викентий имеет латинское происхождение и восходит к слову vincens — «побеждающий».Имя Иннокентий в переводе с греческого означает «невинный».

Согласно другой версии, в основе фамилии Екенин лежит прозвище Екен, которое, предположительно, восходит к диалектному слову, бытовавшему у сибирских татар, «йегǝн» - «циновка, сплетенная из камыша». Соответственно, Екеном могли прозвать мастера, изготавливавшего такие циновки. Есть версия, что именование Екен является именем, образованным от той же основы. Екеня, со временем получил фамилию Екенин.