Версия 1

Фамилия Губченко ведет свое начало от прозвища Губка. Прозвище Губка, скорее всего, образовано от нарицательного «губа». Вполне вероятно, что это прозвище отражало особенности внешности предка (полные или, наоборот, тонкие губы).

Согласно другой гипотезе, прозвище Губка ведет свое начало от существительного «губа» в значении «гриб». В таком случае прозвище мог получить грибник или любитель блюд из грибов.

Наконец, существует предположение, что прозвище Губка этимологически связано с белорусским словом «губка», то есть «часть пряжи в кроснах». Исходя из этого, можно предположить, что родоначальник фамилии был ткачом.

Чередование согласных к/ч объясняется историческими процессами в языке.

Позже прозвище Губка, для фамилии Губченко.

Фамилия Губченко образовалась при помощи суффикса -енко. Первоначально он имел следующие значения: «маленький», «молодой человек», «сын». Поэтому Губченко буквально понималось как «сын Губки». Позднее древний суффикс -енко утратил свое прямое значение и сохранился лишь в качестве фамильного.