Версия 1

Фамилия Гниленко ведет свое начало от прозвища Гнила. Прозвище Гнила этимологически связано с прилагательным «гнилой», то есть «разрушенный, попорченный гниением, тлением», «нечестный, беспринципный». Таким образом, прозвище Гнила, вероятно, получил нечистоплотный человек. Также так могли именовать того, кто в своем поведении порой не соблюдал моральные нормы и принципы.

Позже прозвище Гнила, для фамилии Гниленко.

Фамилия Гниленко образовалась при помощи суффикса -енко. Первоначально он имел следующие значения: «маленький», «молодой человек», «сын». Поэтому Гниленко буквально понималось как «сын Гнилы». Позднее древний суффикс -енко утратил свое прямое значение и сохранился лишь в качестве фамильного.