Версия 1

Основой фамилии Гнатышин послужило церковное имя Игнатий. Скорее всего, фамилия Гнатышин восходит к крестильному мужскому имени Игнатий, которое в переводе с латинского означает «неведомый, огненный». Традиционно это имя давалось ребенку, чтобы уберечь его от злых духов, так как делало рождение малыша незаметным для темных сил. Святым покровителем обладателей имени Игнат считается патриарх Игнатий Константинопольский.

Вероятно, основатель рода Гнатышиных был человеком из простого сословия. Дело в том, что фамилии, образованные от полной формы имени, имела в основном социальная верхушка, знать, или семьи, пользовавшиеся в данной местности большим авторитетом, представителей которых соседи уважительно звали полным именем, в отличие от других сословий, звавшихся, как правило, уменьшительными, производными, обиходными именами.

Согласно другой, менее правдоподобной версии, в основе этой фамилии лежит украинское слово «гнати» - «принуждать быстро бежать, идти, ехать». Исходя из этого, можно предположить, что основатель рода Гнатышиных был лихим ямщиком или извозчиком. Тогда фамилия относится к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности человека.