Версия 1

Фамилия Ганенко образована от имени собственного и относится к распространенному типу украинских фамилий.

Основой фамилии Ганенко послужило мирское имя Ганя. Фамилия Ганенко была распространена в восточных районах Украины, на это указывает суффикс -енко. Возможно, что она происходит от прозвища Гана из нарицательного «гана» (в переводе с украинского – «осуждение»). Скорее всего, предок обладателя фамилии вел образ жизни, в чем-то отличный от общепринятого, за что его и осуждали односельчане. Однако такое прозвище мог получить и брюзгливый, придирчивый человек.

Согласно другой, более правдоподобной версии, фамилия Ганенко была образована от имени Гавриил. В основе фамилии лежит его уменьшительная форма – Ганя, Ганька. Само имя Гавриил имеет древнееврейские корни, а на русский переводится как «божественный воин». Ганя, со временем получил фамилию Ганенко.