Версия 1

Фамилия Вилюжанин образована от прозвища, которое получил человек, живший на берегу реки Вилюй, протекающей в Якутии и Красноярском крае. Вилюй — крупнейший левый приток Лены. Поскольку топонимические фамилии содержали указание не только на принадлежность к конкретной семье, но и на отношение к определенному географическому объекту, то изначально они представляли собой прилагательные с различными формантами: фамилии на – ский /-цкий и –анинов /-янинов принадлежат в основном знати и дворянству; фамилии на –итов /-ичев, -инов, -цев, - яков /-аков, - ников, -ин, -их /-ых. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Вилюжанин, со временем получил фамилию Вилюжанин.