Версия 1

Фамилия Боканенко ведет свое начало от прозвища Бокан. Прозвище Бокан, вероятно, восходит к нарицательному «бок» и, скорее всего, указывает на особенности внешности предка. Так, основатель рода Боканенко мог иметь какой-либо физический недостаток, например, припадать на один бок при ходьбе.

Кроме того, прозвище Бокан мог получить человек полный, то есть широкий в боках. При этом в старину полнота не воспринималась как что-то зазорное. Напротив, она считалась признаком красоты, здоровья и ассоциировалась с сытой жизнью и материальным благополучием.

Позже прозвище Бокан, для фамилии Боканенко.

Фамилия Боканенко образовалась при помощи суффикса -енко. Первоначально он имел следующие значения: «маленький», «молодой человек», «сын». Поэтому Боканенко буквально понималось как «сын Бокана». Позднее древний суффикс -енко утратил свое прямое значение и сохранился лишь в качестве фамильного.