Версия 1

В семинарской среде даже бытовала поговорка, в которой перечислялись основные источники искусственных фамилий: «По церквам, по цветам, по камням, по скотам, и яко восхощет его преосвященство».

Скорее всего, фамилия Богороденко имеет семинарское (искусственное) происхождение. Богородица (Дева Мария) — мать Иисуса Христа, одна из самых почитаемых фигур, в особенности в православии и католицизме. Личность Богородицы полулегендарна. Датой её рождения иногда называют 20 год до нашей эры, а её смерть церковное предание относит к 48 году нашей эры.

Согласно другой версии, фамилия Богороденко содержит указание на место жительства предка, например, село Богородское (название дано по расположенной на его территории церкви Пресвятой Богородицы).