Версия 1

Фамилия Боганец, вероятно, образована от аналогичного прозвища, в основе которого лежит название реки Баган, протекающей в юго-западной части Новосибирской области. Скорее всего, основатель рода Боганец жил на берегах этой реки.

Происхождение самого названия Баган точно неизвестно. По одной из версий, оно происходит от тюркского «баган» — «столб». По другой, оно связано со старинным русским словом «багно» — «низкое, топкое место». Вторая версия представляется более правдоподобной, так как река Баган частично протекает по болотистой местности.

Согласно еще одной, менее вероятной гипотезе, прозвище Боганец восходит к слову «баган», которое в смоленских говорах имеет значение «некий добрый и злой дух, покровитель скота». В этом случае так могли прозвать пастуха или того, кто держал много скота.

Чередование гласных а/о обусловлено особенностями произношения и записи в официальных документах. Поскольку топонимические фамилии содержали указание не только на принадлежность к конкретной семье, но и на отношение к определенному географическому объекту, то изначально они представляли собой прилагательные с различными формантами: фамилии на – ский /-цкий и –анинов /-янинов принадлежат в основном знати и дворянству; фамилии на –итов /-ичев, -инов, -ец, -цев, - яков /-аков, - ников, -ин, -их /-ых - представителям всех остальных сословий. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Боганец, со временем получил фамилию Боганец.