Версия 1

Фамилия Бакуняев образована от прозвища Бакуняй. В старину бакуном называли простой русский папушный табак. Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Бакуняй относилось к числу «профессиональных» именований: его могли дать тому, кто выращивал и продавал этот сорт табака. Однако не исключено, что прозвище Бакуняй получил человек, куривший этот табак.

Согласно одной из версий, в основе прозвища лежит глагол «бакунить» – «говорить, разговаривать». Поэтому Бакуняем могли называть говоруна, хорошего рассказчика.

Возможно также, что фамилия Бакуняев происходит от имени Бакуняй, уменьшительной формы крестильного имени Аввакум. Оно имеет древнееврейское происхождение и переводится на русский язык как «обнимающий». Святым покровителем этого имени считается пророк Аввакум Персиянин.

В «Ономастиконе» С.Б. Веселовского упоминаются однокоренные фамилии : Бакуня Голощапов, крестьянин, 1579 г., Шуя; Иван и Михаил Ивановичи Бакунины, 1568 г., Ярославль. Бакуняй, со временем получил фамилию Бакуняев.