Версия 1

Фамилия Агнищенко ведет свое начало от прозвища Агнище. Прозвище Агнище, скорее всего, восходит к украинскому нарицательному «огнище», то есть «очаг» - «свое жилище, семья». Согласно этому, можно предположить, что Агнищем назвали хорошего семьянина.

Также прозвище Агнище может быть связано со словом «огнище» в значении «княжеский дом». В этом случае прозвище Агнище мог получить человек, принадлежавший к княжескому дому.

Чередование гласных а/о можно объяснить влиянием «акающих» говоров русского языка.

Позже прозвище Агнище, для фамилии Агнищенко.

Фамилия Агнищенко образовалась при помощи суффикса -енко. Первоначально он имел следующие значения: «маленький», «молодой человек», «сын». Поэтому Агнищенко буквально понималось как «сын Агнища». Позднее древний суффикс -енко утратил свое прямое значение и сохранился лишь в качестве фамильного.