Версия 1

Фамилия Аганин, скорее всего, образована от названия реки Аган в Ханты-Мансийском автономном округе. Аган - левый приток реки Тромъеган, близ впадения её в Обь, длина 544 км, площадь бассейна 32 200 км².

Истоки Агана расположены на возвышенном болотистом водоразделе бассейна реки Пур и правых притоков Оби. Протекает в центральной части Западно-Сибирской равнины. Поскольку топонимические фамилии содержали указание не только на принадлежность к конкретной семье, но и на отношение к определенному географическому объекту, то изначально они представляли собой прилагательные с различными формантами: фамилии на – ский /-цкий и –анинов /-янинов принадлежат в основном знати и дворянству; фамилии на –итов /-ичев, -инов, -цев, - яков /-аков, - ников, -ин, -их /-ых. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Аган, со временем получил фамилию "аганин".