Версия 1

Фамилия Губонин происходит от прозвища Губоня. Оно восходит к существительному «губа» со значением «края рта у человека и животных».

Возможно, прозвище Губоня указывает на особенности внешности его обладателя. Так могли назвать человека с пухлыми губами.

Не исключено, что фамилия Губонин берет начало от прозвища Губоня, образованного от существительного «губа», которое имеет значение «морской залив» или «край, уезд; селение, двор, изба; округ, владение». Вероятно, именование Губоня указывало на место жительства его обладателя или особенности его дома, размеры хозяйства.

Фамилии, восходящие к существительному «губа», достаточно древние. Об этом свидетельствуют документы XV-XVII века, где упоминаются новгородский крестьянин Иван Губанов, дворянин и потомок выходца из Смоленска Алексей Иванович Губанов, крестьянин Иван Губанов. Губоня легло в основу фамилии Губонин. При образовании славянских фамилий использовались различные форманты: суффиксы принадлежности (-ов/-ев, -ин, -ский/-цкий), уменьшительные суффиксы (-онок/-ёнок, -енко, -ко, -ец, -ек, -ик, -чик, -еня), суффиксы отчества (-ович/-евич, -ич) и др. Губоня, со временем получил фамилию Губонин.

Среди известных однофамильцев можно назвать промышленника и мецената XIX века Петра Ионовича Губонина, а также русского художника и историка церкви Михаила Ефимовича Губонина.