Версия 1

Основой фамилии Геня послужило церковное имя Геннадий. Фамилия Геня, вероятно, образована от уменьшительной формы имени Геннадий, которое в переводе с греческого означает «благородный, великородный, родовитый, благородного происхождения».

Кроме того, не исключено, что в основе фамилии лежит производная форма таких греческих имен, как Евгений («благородный»), Протоген («первенец»), Афиноген («потомок богини Афины»).

По другой версии, фамилия Геня восходит к топониму Геня — такое называние носит село в Габровской области Болгарии. Можно предположить, что основатель рода Геня был уроженцем этого села.

Согласно еще одной, менее вероятной гипотезе, данная фамилия происходит от еврейского имени Геня, которое означает «приятная, красивая» или «благо, радость». Нужно отметить, что среди еврейских фамилий процент метронимических гораздо выше, чем у других народов. Это связано с тем, что у евреев (особенно в Европе) женщины в XVIII-XIX веках играли более активную социальную и экономическую роль, чем у их христианских соседей.