Версия 1

Фамилия Вахненко образована от имени собственного и относится к распространенному типу украинских фамилий. Основой фамилии Вахненко послужило имя Вахня. Фамилия Вахненко образована от просторечного имени Вахня. Как правило, оно образовывалось от любого крестильного имени, начинающегося со слога Ва-. Поскольку среди таких имени наиболее распространенным было Ваня (форма от церковного Иоанн), то можно предположить, что именно оно стало производящей основой для Вахня.

Имя Иоанн имеет древнееврейское происхождение и переводится на русский язык как «милость Божья». Известно, что в древней Иудее оно произносилось как Йоханаан. Русское же имя, вероятно, происходит от прародителя славян Вана, поскольку в древности всех славян называли «ваннами». Христианство прибавило к имени только одну букву «и». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Вахня, со временем получил фамилию Вахненко.