Версия 1

Фамилия Вагин образована от прозвища Вага. Так обычно называли того, кто жил на берегу реки Ваги (приток Северной Двины). На Севере так в расширительном смысле называли простого, необразованного крестьянина. В таможенных книгах 1675-1676 годов по Устюгу и Тотьме многократно упоминались купцы с Ваги: Важенин Григорий Игнатов, Важенин Леонтий Петров.

Согласно другой версии, фамилия образована от прозвища Вага из нарицательного «вага», т.е. «вес, тяжесть». Скорее всего, так могли называть важного человека. В ярославских, северо-двинских говорах это существительное имело значение «мужик, вахлак», в вологодских – «грубый, ленивый человек», в архангельских, вологодских – «шалун, шутник, весельчак».

Существует и такая гипотеза: фамилия восходит к старинному редкому мужскому имени Евагрий, которое в переводе с греческого означает «счастливый на охоте». В основе же фамилии лежит краткая форма — Ваган.

В «Ономастиконе» академика С.Б. Веселовского упоминаются: Вага Павел Гаврилов, посадский человек, 1623 г., Гороховец; Ваганков Иван, чернец, 1440 г., Углич Вагин Четвертый, 1610 г., Белоозеро. Вага, со временем получил фамилию Вагин.