Версия 1

Фамилия Ваганцев восходит к прозвищу Ваганец, которое предположительно образовано от диалектного глагола «ваганиться», то есть «баловать, шалить, играть, шутить». Таким образом, Ваганцем могли прозвать человека, склонного к проказам, имевшего обыкновение подшучивать над окружающими.

Менее вероятно, что прозвище Ваганец происходит от существительного «ваган» в значении «вахлак, простой крестьянин, мужик». Эта версия представляется менее правдоподобной ввиду того, что нарицательное со значением «мужик» вряд ли могло идентифицировать человека, указать на его отличительные признаки, выделить его среди других крестьян-мужиков.

Возможно и то, что Ваганцем прозвали выходца с берегов реки Ваги, протекающей в Вологодской и Архангельской областях, которая является крупнейшим левым притоком Северной Двины.

Согласно ещё одной версии, фамилия Ваганцев образована от мужского армянского имени Ваган, которое переводится как «щит» или «вездесущий».