Версия 1

Фамилия Бухора, вероятно, ведет свое начало от мужского имени Бухор, которое восходит к названию древнего узбекского города Бухара. В прежние времена татарские муллы, учившиеся в бухарских медресе, часто назвали своих сыновей именами Бухар, Бухор, Бухарай и т.п. Само же название города Бухара восходит к древнесанскритскому слову «вихара», что значит «монастырь, храм Будды».

Именование Бухора, вероятно, изначально понималось как «сын Бухора». Образование фамилий с помощью формы родительного падежа характерно для украинского языка. Поэтому фамилия Бухора, возможно, возникла под украинским влиянием.

По другой версии, фамилия Бухора ведет свое начало от аналогичного прозвища, в основе которого лежит диалектное русское слово «бухара». Бухарой называется покосный участок в лесу, следовательно, владелец такого участка мог получить прозвище Бухара, которое под влияние «окающих» говоров изменилось на Бухора.

Кроме того, в севернорусских говорах бухарой называли пчелу, шмеля. Поэтому прозвище Бухора могло закрепиться за трудолюбивым человеком или острословом (способным «ужалить» при помощи слова). Иногда же именование главы семейства переходило к потомку в неизменной форме. Таким образом, потомок человека, которого звали Бухор, со временем получил фамилию Бухора.