Версия 1

Фамилия Бухаркин образована от прозвища Бухарок. Оно ведет свое начало от диалектного нарицательного «бухара» - «запольная, пустошная земля, где каждые 3-4 года сеется рожь», «сенокос в лесу, где растет трава лист, листуга», «ушастая шапка, опушенная пыжиком», «камин, комелек, чувал». Вероятно, прозвище относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на деятельность основателя фамилии: он мог быть земледельцем, сенокосцем, мастером по пошиву головных уборов, либо печником.

Согласно другой гипотезе, фамилия Бухаркин восходит к топониму Бухара (или Букара) — один из древнейших городов Узбекистана. Возраст Бухары превышает 2500 лет. В древности она входила в состав одной из областей Средней Азии — Согда, где уже во времена Александра Македонского была развита градостроительная структура.

Недалеко от города располагалось античное поселение Варахша, известное своими великолепными настенными росписями, представлявшими сцены охоты на гепардов. Центром Бухары является крепость Арк, где проживали правители и их приближённые. За её стенами сложился собственно город — «шахристан». Его окружали торгово-ремесленные предместья — «рабад». Через Бухару пролегал Великий шелковый путь. Здесь было более 60 караван-сараев, где размещались купцы из Индии, Китая, Ирана и других стран.

Сам топоним Бахара в переводе с согдийского языка означает «удачная местность».

Можно предположить, что основатель рода Бухаркиных родился или долгое время жил в Бухаре. Бухарок, со временем получил фамилию Бухаркин.