Версия 1

Фамилия Братченя относится к распространенному типу украино-белорусская фамилий и образована от личного прозвища. Так, фамилия Братченя ведет свое начало от аналогичного прозвища. Прозвище Братченя образовано от аналогичного украинского нарицательного со значением «брат», «двоюродный брат», «сводный брат», «друг, товарищ». Прозвище закрепляло родственные отношения между детьми в старину. Естественно, «братские» фамилии были достаточно широко распространены.

Возможно также, что Братченей прозвали доброго, отзывчивого человека или хорошего, верного друга.

Согласно еще одной гипотезе, основой для прозвища послужило слово «брат» в значении «член религиозного братства; монах». В таком случае прозвище Братченя указывало как на религиозные взгляды, так и на род деятельности основателя фамилии.