Версия 1

Фамилия Бохоненко ведет свое начало от прозвища Бохон. Прозвище Бохон, скорее всего, восходит к аналогичному нарицательному. В «Толковом словаре живого великорусского языка» В.И. Даля оно трактуется как «каравай хлеба, коврига». Вполне вероятно, что такое прозвище получил любитель выпечки.

Не исключено также, что прозвище Бохон относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на род деятельности человека: возможно, предок обладателя фамилии Бохоненко был пекарем.

Позже прозвище Бохон, для фамилии Бохоненко.

Фамилия Бохоненко образовалась при помощи суффикса -енко. Первоначально он имел следующие значения: «маленький», «молодой человек», «сын». Поэтому Бохоненко буквально понималось как «сын Бохона». Позднее древний суффикс -енко утратил свое прямое значение и сохранился лишь в качестве фамильного.