Версия 1

Основой фамилии Богонников послужило мирское имя Богонник. Мирское имя Богонник восходит к названию растения багонник: так в некоторых говорах называют багульник болотный. Это ядовитое растение местами образует заросли на больших пространствах (на Украине — преимущественно в Ровенской, Волынской, Житомирской, Киевской областях). Это растение встречается и в Полесье, особенно обильно в Западном и Правобережном. Как правило, багонник произрастает на заболоченных местах в хвойных лесах, на сфагновых болотах и торфяниках. В народной медицине его используют при остром и хроническом бронхите, туберкулезе, заболеваниях кожи.

До введения христианства наречение ребенка именем, представляющим собой название животного или растения, было очень распространённой традицией. Это соответствовало языческим представлениям человека о мире.

Древнерусский человек, живший по законам природы, сам представлял себя частью природы. Давая младенцу такое имя, как Богонник, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель растительного мира.

Замена гласного «а» на «о» произошла в результате влияния «окающих» говоров. Богонник, со временем получил фамилию Богонников.