Версия 1

Фамилия Бессарабенко образована от прозвища Бессараб, которое ведет свое начало от названия исторической области Бессарабия, расположенной между Черным морем и реками Дунай, Прут, Днестр. Бессарабия — восточная часть исторической Молдавии. Скорее всего, основатель рода Бессарабенко был уроженцем этих земель.

Сам же топоним Бессарабия (по-румынски Ţara lui Basarab — «Земля Бессараба») происходит от имени валашского воеводы Бассараба I Великого (1289—1352), который правил с 1310 года.

Суффикс –енко указывает на то, что фамилия Бессарабенко сформировалась в восточных районах Украины или Белоруссии. Соответственно, за основу дворянских фамилий бралось название тех мест, которыми владели привилегированные классы.