Версия 1

Фамилия Баймаков образована от прозвища Баймак, которое восходит к топониму Баймак — это город в России, административный центр Баймакского района Башкортостана. Город расположен на восточном склоне Южного Урала, в отрогах хребта Ирендык, в верхнем течении реки Таналык (бассейн Урала), в 489 км к югу от Уфы. На территории района находится озеро Талкас (село Исяново). Возле озера находится санаторий Талкас, лагерь Орлёнок, Берёзка. Богатая природа и живописные места.

Широко известна местная турбаза «Графское озеро», основанная в XVIII веке бельгийским золотопромышленником графом Ротенмундтом. Уникальность турбазы в том, что она располагается на острове посередине озера.

Вероятно, основатель рода Баймаковых был уроженцем этого города, либо долгое время жил в нем.

Согласно другой версии, в основе фамилии лежит татарское мужское имя Баймак, что в переводе на русский язык означает «богатеющий». Вероятно, нарекая ребенка таким именем, родители желали, чтобы их сын в будущем стал знатным и богатым человеком.