Версия 1

Фамилия Бабунин образована от прозвища Бабуня. Оно ведет свое начало от аналогичного нарицательного, которое в некоторых диалектах имело значение «бабушка». Вероятно, прозвище Бабуня получил воспитанник бабушки или ее любимец. На Руси бытовала поговорка: «Была б моя бабуся, никого не боюся; бабушка щипок, кулак молоток».

Согласно другой гипотезе, в основе фамилии Бабунин лежит не прозвище, а мирское имя Бабуня, восходящее к названию земляного зайца – бабун. До введения на Руси христианства наречение ребенка именем, представляющим собой название животного или растения, было очень распространенной традицией. Это соответствовало языческим представлениям человека о мире. Древнерусский человек, живший по законам природы, сам представлял себя ее частью. Давая младенцу такое имя, как Бабуня, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребенка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделен земляной заяц. Бабуня легло в основу фамилии Бабунин.

Уже в XV–XVI веках начинают передаваться из поколения в поколение первые фамилии, которые подчёркивали принадлежность человека к конкретной семье. В результате прозвище человека закреплялось за его потомками и домочадцами, оформляясь при этом различными суффиксами.

При образовании славянских фамилий использовались различные форманты: суффиксы принадлежности (-ов/-ев, -ин, -ский/-цкий), уменьшительные суффиксы (-онок/-ёнок, -енко, -ко, -ец, -ек, -ик, -чик, -еня), суффиксы отчества (-ович/-евич, -ич) и др. Бабуня, со временем получил фамилию Бабунин.