Версия 1

Фамилия Афоненко относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Афанасий. После 988 г. каждый славянин во время официальной церемонии крещения получал от священника крестильное имя. Такое именование позволяло решать проблему идентификации: выделения конкретного человека из общества. Поэтому именно церковные имена и стали активной базой для создания фамилий.

Фамилия Афоненко восходит к крестильному имени Афанасий (от греческого Атанасиа , что в переводе на русский язык означает «бессмертие»), которое ранее было широко распространено среди простых людей. Основой же для фамилии послужила его просторечная форма - Афоня.

Одним из покровителей имени является преподобный Афанасий Мидикийский, который по любви к иноческой жизни тайно ушел из родительского дома, но был насильно возвращен отцом. Однако через некоторое время Афанасий с разрешения отца поступил в Мидикийский монастырь, в Вифинии. Он был сподвижником преподобного Никиты (память 3 апреля) и скончался около 814 года. На его могиле выросло кипарисовое дерево, от которого, по благодати Божией, происходили исцеления.

Вероятнее всего, образование фамилии Афоненко началось приблизительно в XIV веке, что обусловлено историческими процессами. Так, с XVI столетия Украина тесно контактировала с европейскими народами.

Фамилия Афоненко образовалась при помощи суффикса -енко. Первоначально он имел следующие значения: «маленький», «молодой человек», «сын». Поэтому Афоненко буквально понималось как «сын Афони». Позднее древний суффикс -енко утратил свое прямое значение и сохранился лишь в качестве фамильного. Однако .