Версия 1

В начале IV века в Грузии было принято христианство, и детям стали давать христианские имена. Греческие календарные имена получили большое распространение и постепенно стали вытеснять мусульманские. Однако христианские имена, в отличие от турецко-арабских, нередко претерпевали изменения. Так появились Акаки, Амброси, Геронти, Павле, Тевдоре, Текле, Елисабед, Маро, Агати – грузинские аналоги греческих имен. Фамилия Аганидзе, скорее всего, образована от названия реки Аган в Ханты-Мансийском автономном округе. Аган - левый приток реки Тромъеган, близ впадения её в Обь, длина 544 км, площадь бассейна 32 200 км².

Истоки Агана расположены на возвышенном болотистом водоразделе бассейна реки Пур и правых притоков Оби. Протекает в центральной части Западно-Сибирской равнины.

Вероятно, предок обладателя фамилии Аганидзе был уроженцем населенного пункта, расположенного в долине реки Аган. А вот сванский суффикс –ани может указывать на знатное происхождение родоначальника.